Ministarstvo vanjske trgovine i ekonomskih odnosa nadležno je za:

• vanjskotrgovinsku i carinsko-tarifnu politiku BiH;
• pripremanje ugovora, sporazuma i drugih akata iz oblasti ekonomskih odnosa i trgovine s drugim državama;
• pripremanje bilateralnih i multilateralnih sporazuma i drugih akata vezanih za obnovu i rekonstrukciju BiH;
• odnose s međunarodnim organizacijama i institucijama iz oblasti vanjske trgovine i ekonomskih odnosa;
• pripremu i izradbu makroekonomskih odnosa strateških dokumenata iz oblasti ekonomskih odnosa;
• poslovno okruženje, jedinstven ekonomski prostor;
• razvoj i promociju poduzetništva;
• kontrolu prometa roba i usluga koji imaju poseban režim u prometu odnosa u izvozu i uvozu;
• zaštitu potrošača;
• konkurenciju;
• usklađivanje međunarodne ekonomske pomoći BiH, osim dijela koji se odnosi na pomoć Europske unije;
• veterinarstvo.

Ministarstvo je nadležno i za obavljanje poslova i zadataka iz nadleštva BiH koji se odnose na definiranje politike, temeljnih načela, usklađivanje djelatnosti i planova entitetskih tijela vlasti i institucija na međunarodnom planu u područjima:

• poljoprivrede;
• energetike;
• zaštite okoliša, razvoj i korištenje prirodnih resursa;
• turizma.

U sastavu ovog Ministarstva kao upravna organizacija je Ured za veterinarstvo BiH, Uprava BiH za zaštitu zdravlja bilja i Ured za harmonizaciju i koordinaciju sustava plaćanja u poljoprivredi, prehrani i ruralnom razvitku Bosne i Hercegovine.