Ministarstvo vanjske trgovine i ekonomskih odnosa nadležno je za:

• vanjskotrgovinsku politiku i carinsko-tarifnu politiku BiH;
• pripremanje ugovora, sporazuma i drugih akata iz oblasti ekonomskih odnosa i trgovine sa drugim državama;
• pripremanje bilateralnih i multilateralnih sporazuma i drugih akata vezano za obnovu i rekonstrukciju BiH;
• odnose sa međunarodnim organizacijama i institucijama iz oblasti vanjske trgovine i ekonomskih odnosa;
• pripremu i izradu makroekonomskih odnosno strateških dokumenata iz oblasti ekonomskih odnosa;
• poslovno okruženje, jedinstven ekonomski prostor;
• razvoj i promociju preduzetništva;
• kontrolu prometa roba i usluga koji imaju poseban režim u prometu odnosno u izvozu i uvozu;
• zaštitu potrošača;
• konkurenciju;
• koordinaciju međunarodne ekonomske pomoći BiH izuzev dijela koji se odnosi na pomoć Evropske unije;
• veterinarstvo.

Ministarstvo je nadležno i za obavljanje poslova i zadataka iz nadležnosti BiH koji se odnose na definisanje politike, osnovnih principa, kooridniranje djelatnosti i usklađivanje planova entitetskih tijela vlasti i institucija na međunarodnom planu u područjima:

• poljoprivrede;
• energetike;
• zaštita okoline, razvoj i korištenje prirodnih resursa;
• turizma.

U sastavu ovog Ministarstva kao upravna organizacija je Ured za veterinarstvo BiH, Uprava BiH za zaštitu zdravlja bilja i Ured za harmonizaciju i koordinaciju sistema plaćanja u poljoprivredi, ishrani i ruralnom razvoju Bosne i Hercegovine.